في هذا الجزء بعد سنة واحدة بعد الحرب العالمية الرابعة، سايبورغ والقراصنة موتوكو كوساناجي من الوحده السرية 501 للجيش يجدون انفسهم في تحقيق عميق ومعقد في تفجير المدمرة.